Суммирую пожелания по Японскому КиберКроту, накопившиеся к настоящему моменту.

Окно выбора номера:
- увеличить место, занимаемое деревом номеров, насколько возможно;
- выделить свежие номера на сайте;
- добавить галочку "Показывать все номера на сайте", определяющую, будут ли в списке номеров на сайте те, которые уже есть на компьютере;
- при обращении к сайту за списком номеров проверять, не вышла ли более свежая версия программы.

Решение кроссвордов:
- возможность закрасить не только линию, но и прямоугольник;
- сохранять решение, даже если единственное изменение - введенное ключевое слово;
- автоматическое сохранение решения через определенный промежуток времени;
- горячая клавиша сохранения решения.

Интерфейс:
- добавить в настройки пункт "комфортный размер клетки" и дополнительную кнопку в панели масштабирования (с горячей клавишей) для переключения именно на этот масштаб;
- выделять на палитре цветов текущий цвет.

Запуск программы:
- при двойном щелчке на файле с расширением .jkrt должна открываться программа Японский КиберКрот (если, конечно, она установлена на компьютере). Номер при этом должен добавляться в список.

Пока что ничего из этого не сделано (кроме того, что окно выбора номера в последней версии можно растягивать).

Будут еще предложения?

Заливка: подумаю, вряд ли она будет действительно востребована, а как ее органично включить в существующий интерфейс - пока не представляю.

Не выводить Шифр: тогда нужно предусмотреть где-то его отображение... Принято.

Время чтения списка номеров: по-прежнему не понимаю, зачем хранить разгаданные номера в таком количестве, но оптимизировать это можно, почему бы и нет?

Win2k: узнал о проблеме от вас. Может быть, потому, что больше никто уже этой ОС не пользуется? Честно говоря, даже не представляю, где ее сейчас взять, чтобы это проверить. Скорее склонен отказаться от поддержки любых ОС до ХР. Под Win98 программа тоже вряд ли запустится...

Чтобы указать тех. требования, их сначала нужно выявить, то есть проверить работу программы на различных конфигурациях. Это нудная и практически никому не нужная работа, такая же, как и поддержка древних систем.
Я предпочел сделать все возможное, чтобы программа запускалась на любом сколько-нибудь современном компьютере с современной ОС (ну, и ХР тоже )

Не очень понял, что к чему прилипает. По-хорошему, надо бы, чтобы экран прокручивался вслед за курсором при рисовании. Но пока что можно только двигать его стрелками, не отпуская мышь.

Такое предложение у меня давно есть
Его реализация, к сожалению, не так тривиальна, как кажется на первый взгляд. Возможно, в этой версии постараюсь сделать такую опцию...

Подобные программы есть, но ими о-о-очень неудобно пользоваться) Сомневаюсь, что в этой области можно изобрести что-то кардинально иное... разумеется, если речь идёт об обычных телефонах... маленьких таких а не о монстрах технического прогресса  

известно, что когда кросс решен без ошибок, появляецца окно ввода ключевого слова с соответствующим сообщением,
но
помимо этого должны быть еще закрыты все пустые места, иначе окна не будет, хотя кросс и решен правильно,
особенно это касаецца цветных кроссов, поскольку их легко разгадывать и без крестиков,
легкий такой дискомфорт,
примите к сведению,
спасибо

Оно появляется и тогда, когда кроссворд решен с ошибками))

Как справедливо заметила rysalka, окно всплывает не тогда, когда кроссворд решен, а тогда, когда все закрашено. При неправильном решении все цифры не могут быть серыми.

А также:

Не нужно увеличивать само окно.
Нужно добавить возможность самому пользователю увеличивать окно мышью (с уголка, снизу), как скажем в браузерах при выборе / сохранении изображений.